СВЕДЕНИЯ О ФАКТИЧЕСКОМ НАЛИЧИИ ИМУЩЕСТВА ЗАПИСЫВАЮТСЯ В
1) журнал предметно- количественного учета
2) накладную
3) инвентаризационную опись (акт инвентаризации) (+)
4) приказ о проведении инвентаризации

Верный вариант — 3) инвентаризационная опись (акт инвентаризации). Именно в этом документе фиксируют фактическое наличие товаров, материалов и другого имущества при проведении инвентаризации. Для фармацевтической организации это особенно важно, потому что нужно документально подтвердить, сколько препаратов и иных ценностей реально находится в наличии на момент проверки, а затем сопоставить эти данные с учетными остатками.

Остальные документы используются для других целей: журнал предметно-количественного учета нужен для текущего учета движения отдельных товаров, накладная подтверждает отпуск или поступление, а приказ только оформляет само проведение инвентаризации. То есть фактические остатки всегда вносят именно в инвентаризационную опись или акт инвентаризации.

Документ	Для чего применяется	Что отражает	Подходит для фиксации фактического наличия
Инвентаризационная опись	Оформление результатов инвентаризации	Реальное наличие имущества на дату проверки	Да
Акт инвентаризации	Подтверждение итогов инвентаризации	Фактические остатки, выявленные расхождения	Да
Журнал предметно-количественного учета	Текущий учет движения товаров	Приход, расход, остаток по учетным данным	Нет
Накладная	Оформление поступления или отпуска товара	Передачу товарно-материальных ценностей	Нет
Приказ о проведении инвентаризации	Организация и назначение проверки	Основание, сроки, состав комиссии	Нет
Сличительная ведомость	Сравнение факта и учета	Излишки и недостачи	Нет, это уже этап анализа

Для запоминания: приказ — начать, опись/акт — зафиксировать факт, сличительная ведомость — сравнить с учетом.