В АПТЕКЕ ТОВАРНЫЕ ПОТЕРИ (ЕСТЕСТВЕННУЮ УБЫЛЬ, БОЙ, ПОРЧУ И ПР.) ОТНОСЯТ К
1) мелкооптовому отпуску
2) недостаче
3) прочему документированному расходу (+)
4) розничной реализации

Правильно: 3) прочему документированному расходу. В бухгалтерском и управленческом учёте аптеки естественная убыль, бой и порча относятся к расходам, подтверждённым актами (ТОРГ-15/ТОРГ-16, внутренние акты списания, заключения комиссии). Это не реализация (ни розничная, ни мелкооптовая) и не недостача как результат инвентаризации без подтверждающих причин — это именно документированное списание товарных потерь.

Для фармацевтической организации важно фиксировать причину и основание списания: нормы естественной убыли, условия хранения, транспортные повреждения, истечение срока годности и т. п. Корректное оформление актов защищает компанию при проверках и позволяет верно отразить НДС и себестоимость.

Вид потерь	Типичные причины/примеры	Куда относить	Первичные документы	НДС/учёт	Комментарий
Естественная убыль в пределах норм	Испарение, усушка, пересортица в пределах норм	Прочие документированные расходы	Акт списания/комиссионный акт, нормы убыли	Включается в расходы периода; входной НДС — по общим правилам	Требуется обоснование и утверждённые нормы
Бой/повреждение при приёмке	Разбитые флаконы, повреждённые упаковки	Прочие документированные расходы (либо претензия поставщику)	ТОРГ-15/ТОРГ-16, акт расхождений, претензия	При возмещении поставщиком — корректировки; без возмещения — расход	Фиксируйте фото/видеодоказательства
Порча при хранении	Нарушение холодовой цепи , влажность, свет	Прочие документированные расходы	Акт брака, заключение ответственного/комиссии	Расход периода; проверить судьбу входного НДС	Отразить причину и меры предотвращения
Истечение срока годности	ЛП и БАД с просроченным сроком	Прочие документированные расходы	Акт списания, журнал сроков годности	Расход; утилизация — отдельный договор/акт	Контроль остатков по FEFO
Недостача (сверх норм)	Установлена инвентаризацией, нет подтверждающих причин	Недостача (отдельная статья)	Инвентаризационная опись, сличительная ведомость	Может взыскиваться с МОЛ; НДС зависит от обстоятельств	Разграничить с прочими расходами
Мелкооптовый отпуск	Продажа юрлицам/ИП небольшими партиями	Не относится к потерям (это реализация)	Счёт-фактура, накладная, УПД	Выручка, начисление НДС при ОСН	Отдельный канал продаж
Розничная реализация	Продажи конечным потребителям	Не относится к потерям (выручка)	Чек ККТ, кассовая смена	Доходы от реализации	Контроль цен и маркировки